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Título: Delimitação de espécies-linhagens do gênero Pseudoplatystoma (Siluriformes: Pimelodidae) e estimativa da variabilidade genética de P. punctifer
Autor: Machado, Antonio Saulo Cunha
Orientador: Batista, Jacqueline da Silva
Palavras-chave: Delimitações de linhagens genéticas
Genética de populações
Data do documento: 1-Mai-2020
Programa: Genética, Conservação e Biologia Evolutiva - GCBEv
Abstract: The catfishes of the genus Pseudoplatystoma play an important role as top predators in freshwater ecosystems in the neotropical region. The species of this genus are important fishing resources and have a high commercial value in their area of distribution. For a long time, the richness of species of this genus was neglected, where only 3 species were recognized. However, after the morphological revision of the genus, the number of species increased to eight. In the first study of molecular systematics, the species richness was again neglected, as only four distinct species were recognized for the genus: Pseudoplatystoma magdaleniatum, Pseudoplatystoma corruscans, Pseudoplatystoma tigrimun (sensu lato) and Pseudoplatystoma fasciatum (sensu lato). Thus, the first chapter of this study aimed to: Test the mitochondrial markers cytochrome oxidase I (COI) and the control region (RC) as tools to assess species diversity for the genus Pseudoplatystoma based on the methods of delimiting specieslineages single locus. The COI was not efficient in delimiting the different morphospecies, where only five species-lineages were delimited. However, the RC based on the GMYC (Generalized Mixed Yule Coalescent) and bGMYC (Bayesian implementation of GMYC) methods, delimited 9 lineage species, of the 8 morpho-species described for the genus Pseudoplatystoma, thus recognizing the taxonomic diversity of the genus. Until integrative taxonomy studies are carried out to define the taxonomic status of the species of Pseudoplatystoma, we suggest that conservation measures (if necessary) be carried out independently for these nine lineage species identified in this study. For the second chapter: Using microsatellite and mitochondrial (COI) markers, to estimate diversity, genetic differentiation, and gene flow for Pseudoplatystoma punctifer, between sub-basins of the Madeira and Mamoré/Guaporé rivers. It was tested whether the rapids functioned as barriers that limit the gene flow for this species. Three population groups were identified, one representing individuals from the Mamoré/Guaporé sub-basin (upstream of the rapids) and the other two representing individuals from the lower Madeira sub-basin (downstream of the rapids). Some factors may be contributing to the genetic differentiation observed in the lower Madeira and Mamoré / Guaporé sub-basins. Among these factors, we highlight the isolation by distance (given that the species is partially migratory), the restricted gene flow, and the hydrochemical and ecological heterogeneity throughout the study area. Additional studies are needed to understand the pattern of genetic differentiation associated with different types of water for P. punctifer in the Amazon basin. Considering the economic and ecological importance of P. punctifer, we believe that the results of this study can become an important contribution to subsidize adequate conservation and management measures for these species in the sub-basins of Madeira and Mamoré/Guaporé.
Resumo: Os grandes bagres do gênero Pseudoplatystoma desempenham importante papel como predadores de topo nos ecossistemas de água doce na região neotropical. As espécies desse gênero são importantes recursos pesqueiros e apresentam um elevado valor comercial em sua área de distribuição. Durante muito tempo a riqueza de espécies desse gênero foi negligenciada, onde eram reconhecidas apenas 3 espécies. No entanto, após a revisão morfológica do gênero o número de espécies aumentou para oito. No primeiro de estudo de sistemática molecular o a riqueza de espécies voltou a ser negligenciada, pois foram reconhecidas apenas quatro espécies distintas para o gênero: Pseudoplatystoma magdaleniatum, Pseudoplatystoma corruscans, Pseudoplatystoma tigrimun (sensu lato) e Pseudoplatystoma fasciatum (sensu lato). Assim, o primeiro capitulo deste estudo teve como objetivo: Testar os marcadores mitocondriais citocromo oxidase I (COI) e a região controle (RC) como ferramentas de avaliação da diversidade de espécies para o gênero Pseudoplatystoma com base nos métodos de delimitação de espécies-linhagens de locus único. O COI não foi eficiente em delimitar as diferentes morfo-espécies, onde foram delimitadas apenas cinco espécies-linhagens. No entanto, a RC com base nos métodos GMYC (Generalized Mixed Yule Coalescent) e bGMYC (implementação bayesiana do GMYC), delimitaram 9 espécies-linhagens, das 8 morfoespécies descritas para o gênero Pseudoplatystoma, reconhecendo assim a diversidade taxonômica do gênero. Até que estudos de taxonomia integrativa sejam realizados para definição dos status taxonômicos das espécies de Pseudoplatystoma, sugerimos que as medidas de conservação (caso necessárias) sejam realizadas de forma independente para essas nove espécies-linhagens identificadas neste estudo. Para o segundo capítulo: Utilizando marcadores microssatélites e mitocondrial (COI), para estimar a diversidade, diferenciação genética e fluxo gênico para Pseudoplatystoma punctifer, entre sub-bacias dos rios Madeira e Mamoré/Guaporé. Foi testado se as corredeiras funcionavam como barreiras que limitam o fluxo gênico para esta espécie. Foi identificado três grupos populacionais, um representando os indivíduos da sub-bacia do Mamoré/Guaporé (a montante das corredeiras) e os outros dois representando os indivíduos da sub-bacia do baixo Madeira (a jusante das corredeiras). Alguns fatores podem estar contribuindo para a diferenciação genética observada nas sub-bacias do baixo Madeira e Mamoré/Guaporé. Entre esses fatores, destacamos o isolamento por distância (dado que a espécie é parcialmente migratória), o fluxo gênico restrito e a heterogeneidade hidroquímica e ecológica em toda a área de estudo. Estudos adicionais são claramente necessários para entender o padrão de diferenciação genética associado a diferentes tipos de água para P. punctifer na bacia Amazônica. Considerando a importância econômica e ecológica de P. punctifer, acreditamos que os resultados deste estudo podem se tornar uma importante contribuição para subsidiar medidas adequadas de conservação e manejo para essas espécies nas sub-bacias da Madeira e Mamoré/Guaporé.
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