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https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/38858| Título: | Identificação molecular de espécies ee Hypophthalmus e estimativa de variabilidade genética do Mapará - Hypophthalmus edentatus (Siluriformes-Pimelodidae) na Amazônia Brasileira |
| Autor: | Guimarães-Marques, Giselle Moura |
| Orientador: | Batista, Jacqueline da Silva |
| Palavras-chave: | Hypophthalmus Hypophthalmus edentatus |
| Data do documento: | 30-Mai-2022 |
| Programa: | Genética, Conservação e Biologia Evolutiva - GCBEv |
| Abstract: | The taxonomic history of Hypophthalmus is considered confusing and the diversity of species of the genus is underestimated, including incorrect applications of scientific names of some species, making it difficult to understand the relationships between taxa in this genus. However, a recent taxonomic review described its classification. The genus comprises six species: H. oremaculatus, H. fimbriatus, H. edentatus, H. marginatus, H. donascimientoi and H. celiae. They are popularly known as maparás with wide distribution in South America. In the Amazon, commercial fishing practiced especially by the traditional population stands out for the richness of fish species exploited. This practice which may be associated with other factors can affect the composition or even genetic variability of a species Studies of these approaches in species of the genus Hypophthalmus are scarce. We have published an extensive database of DNA barcodes of Hypophthalmus spp. in the Amazon basin Brazilian and adjacent drainages, to delimit species representative of described recent species. The genetic variability of Hypophthalmus edentatus was studied using mitochondrial (COI gene and Control Region) and nuclear (Microsatellite) markers of specimens from 24 Amazonian basin locations. 474 sequences were generated with the COI gene (known as the DNA barcode) models of delimitation of species used, genetic distance, haplotype network, and Bayesian tree were congruent with morphological treatments of the genus. The values of molecular diversity indices point to a high haplotypic diversity (h)= 0.859 and low nucleotide diversity (π) =0.05026 in the genus. For the population study, 15 loci were characterized for H. donascimentoi, characterized in 27 to 33 individuals, from the Solimões River/Amazonas. The microsatellites showed promise to estimate the genetic variability of H. donascimientoi for this reason it was used to the study population of H. edentatus. Due to the lack of information on the genetics of this species, two mitochondrial markers were used: the control region and the cytochrome oxidase gene COI and eight microsatellite loci. High genetic variability with the markers used from the sampled areas was recorded. Of this, the greatest genetic differentiation of the individuals was intraspecific, with a large interspecific gene flow (between localities) but no genetic structure was evidenced, revealing that the migratory catfish H. edentatus composes of a single panmictic population. |
| Resumo: | A história taxonômica de Hypophthalmus é considerada confusa e a diversidade de espécies do gênero subestimada, incluindo aplicações incorretas de nomes científicos de algumas espécies, dificultando a compreensão das relações entre os táxons neste gênero. Porém uma recente revisão taxonômica descreveu a sua classificação. O gênero compreende a seis espécies: H. oremaculatus, H. fimbriatus, H. edentatus, H. marginatus, H. donascimientoi e H. celiae. São conhecidos popularmente como maparás com ampla distribuição na América do Sul. Na Amazônia, a pesca comercial praticada especialmente pela população tradicional, destaca-se pela riqueza de espécies de peixes exploradas. Esta prática que pode estar associada a outros fatores, pode afetar a composição ou mesmo a variabilidade genética de uma espécie. Estudos nestes enfoques em espécies do gênero Hypophthalmus são escassos. Construímos um extenso banco de dados de códigos de barras de DNA de Hypophthalmus spp. da bacia amazônica brasileira e drenagens adjacentes, para delimitar espécies representativas de espécies recentemente descritas. A variabilidade genética de Hypophthalmus edentatus foi avaliada, utilizando marcadores mitocondriais (gene COI e Região Controle) e nucleares (Microssatélites) de espécimes procedentes de 24 localidades da bacia amazônica. Foram geradas 474 sequências com o gene COI (conhecido como DNA barcode) os modelos de delimitação de espécies utilizados, distância genética, rede de haplótipos e a árvore Bayesiana foram congruentes com os tratamentos morfológicos do gênero. Os valores dos índices de diversidade molecular apontam para uma alta diversidade haplotípica (h)= 0,859 e baixa diversidade nucleotídica (π) =0,05026 no gênero. Para o estudo populacional foram caracterizados 15 locos para H. donascimentoi caracterizados em 27 a 33 indivíduos, do rio Solimões/Amazonas. Os microssatélites mostraram-se promissores para estimar a variabilidade genética de H. donascimientoi por esse motivo foi utilizado para estudo populacional de H. edentatus. Devido à falta de informações sobre a genética populacional desta espécie, dois marcadores mitocondriais foram utilizados: a Região Controle e o gene Citocromo Oxidase COI e oito locos de microssatélites. Alta variabilidade genética com os marcadores utilizados das áreas amostradas foi registrada. A maior diferenciação genética dos indivíduos foi intraespecífica, com grande fluxo gênico interespecífico (entre as localidades); porém, não foi evidenciado estruturação genética, revelando que o bagre migrador H. edentatus compõe uma única população panmitica. |
| Aparece nas coleções: | Doutorado - GCBEv |
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