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Título: Avaliação da diversidade genética de plantios de Aniba rosaeodora Ducke em municípios do Amazonas a partir de marcadores microssatélites
Autor: Guedes, Kamylla Rosas Vieira
Orientador: Sampaio, Paulo de Tarso Barbosa
Coorientador: Machado, Antonio Saulo Cunha
Palavras-chave: Aniba rosaeodora Ducke
Pau-rosa
Polimorfismo
Diversidade genética
SSR
Data do documento: 8-Ago-2024
Editor: Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA
Programa: Ciências de Florestas Tropicais - CFT
Abstract: Aniba rosaeodora Ducke (Lauraceae), popularly known as rosewood, is an Amazonian essential oil-producing forest species of great economic importance. Due to the predatory nature of its exploitation in the past, natural populations of A. rosaeodora been drastically reduced and the species it is now considered endangered. There is low genetic knowledge about A. rosaeodora and even less about the effects of its exploitation over the years on the diversity and genetic differentiation of its populations. The aim of this study was therefore to characterize the levels of genetic diversity conserved in A. rosaeodora plantations using microsatellite markers (Simple Sequence Repeats - SSR). To our best knowledge, this is the first study to genetically evaluate rosewood plantations using SSRs. Thirty-two trees with a DBH>15 cm (Diameter at Breast Height) were selected and sampled in two plantations located in the municipalities of Maués and Manaus, both in the state of Amazonas (N=64). Leaf samples collected for the extraction, amplification and genotyping of genomic DNA. Using nine species-specific microsatellite markers, the main genetic diversity parameters estimated: observed heterozygosity (Ho) and expected (He) heterozygosity, total number of alleles (A), fixation index (f), etc. High levels of polymorphism (PIC>0.7) and genetic diversity were detected in both the trees from the commercial plantation in Maués (Ho: 0.743; He: 0.813) and the experimental plantation in Manaus (Ho: 0.844; He: 0.838). The presence of 12 and 18 exclusive alleles verified in the plantations in Maués and Manaus, respectively. The Fst index (0.074; P < 0.001) indicated significant genetic differentiation distributed between the two plantations, which was confirmed by the Structure program, with the formation of three genetic clusters (K=3). Knowledge of the size and breadth of the genetic diversity available in A. rosaeodora plantations could help in the selection of matrices for seed collection in order to establish new plantations of the species. In addition, the results may contribute to the adoption of appropriate conservation strategies for the species, encouraging investment, increasing productivity and reducing pressure on natural populations.
Resumo: Aniba rosaeodora Ducke (Lauraceae), popularmente conhecida como pau-rosa, é uma espécie florestal amazônica produtora de óleo essencial com forte importância econômica. Devido à natureza predatória da sua exploração no passado, populações naturais de A. rosaeodora foram drasticamente reduzidas, levando a espécie a ser considerada ameaçada de extinção. Há pouco conhecimento a nível genético para A. rosaeodora e menos ainda sobre os efeitos da sua exploração ao longo dos anos para a diversidade e diferenciação genética de suas populações. Dessa forma, o estudo teve como objetivo caracterizar os níveis de diversidade genética conservadas em plantios de A. rosaeodora, utilizando marcadores microssatélites (Simple Sequence Repeats – SSR) e, até onde se há conhecimento, este é o primeiro estudo a avaliar geneticamente plantios de pau-rosa com marcadores SSRs. Foram selecionadas e amostradas 32 árvores com DAP>15 cm (diâmetro a altura do peito) em dois plantios localizados nos municípios de Maués e Manaus, ambos pertencentes ao estado do Amazonas (N=64). Amostras foliares foram utilizadas para as etapas de extração, amplificação e genotipagem do DNA genômico. A partir de nove marcadores microssatélites espécie-específicos foram estimados os principais parâmetros de diversidade genética: heterozigosidade observada (Ho) e esperada (He), número total de alelos (A), índice de fixação (f) e afins. Altos níveis de polimorfismo (PIC>0,7) e diversidade genética foram detectados tanto nas árvores do plantio comercial em Maués (Ho: 0,743; He: 0,813) quanto no plantio experimental em Manaus (Ho: 0,844; He: 0,838). Foi também verificada a presença de 12 e 18 alelos exclusivos nos plantios, respectivamente, em Maués e Manaus. O índice de Fst (0,074; P < 0,001) indicou diferenciação genética significativa distribuída entre os dois plantios que foi confirmada pelo programa Structure, com a formação de três clusters genéticos (K=3). O conhecimento da dimensão e amplitude da diversidade genética disponível nos plantios de A. rosaeodora poderá auxiliar na seleção de matrizes para coleta de sementes a fim de estabelecer novos plantios da espécie. Além disso, os resultados podem contribuir para a adoção de estratégias adequadas de conservação da espécie, encorajando investimento, aumento da produtividade e diminuição da pressão em populações naturais.
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