Please use this identifier to cite or link to this item: https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/37512
Title: Proteínas plasmáticas na estimativa da variabilidade genético-populacional da tartaruga da Amazônia (Podocnemis expansa Schweigger, 1812)
Authors: Moura, Arlisson Silva de
metadata.dc.contributor.advisor: Teixeira, Aylton Saturnino
Keywords: Podocnemis expansa
Genética de populações
Proteínas plasmaticas
Quelônios
Issue Date: 18-Sep-2009
Publisher: Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia - INPA
metadata.dc.publisher.program: Genética, Conservação e Biologia Evolutiva - GCBEv
Abstract: This study aimed to test the potential of plasma proteins in the identification of the Amazon turtle stocks (Podocnemis expansa Schweigger, 1812). Through the starch gel electrophoresis technique three protein systems: transferrin (Tf), albumin (Alb) and general protein (GP), and four enzymes: esterase (EST - EC 3.1.1.1), phosphoglucomutase (PGM - EC 2.7.5.1), malate dehydrogenase (MDH - EC 1.1.1.37) and superoxide dismutase (SOD - EC 3.15.1.1), extracted from blood plasma from three population samples: Uatumã-AM, Trombetas-PA and Tapajós-PA, were tested. The zones of electroforetic activity in the gels were presumably coded by 11 loci, of which seven were monomorphic (PG-1, PG-2, EST-1, EST-2, PGM-1, SOD-1 and SOD-2) and four polymorphic (Tf, Alb, MDH and PGM-2). Comparing the genotypic and allelic distribution of the four polymorphic loci detected, the MDH locus was the only one that did not show good genetic balance according to Hardy-Weinberg expectations. The chi-square (x2) analyses to test the hypothesis of independent segregation between the pairs of polymorphic loci examined, revealed no statistically significant differences. Contingency tables for calculating the chi-square (x2) applied to examine the distribution of alleles of the Tf locus, revealed no statistically significant temporal variation (x2 5= 3.05, 0.70 > P > 0.50) in the areas sampled. Despite all existing pressures due especially to the high human consumption of the Amazon turtle in the region, programs for the conservation of its natural populations are ensuring the maintenance of the genetic variability of this species over time, at least for the Tf locus. Estimates of genetic variation showed the highest values of polymorphism (36.36%), average number of alleles per locus (1.36) and mean expected heterozygosity (He) (0.1211), in the Tapajós sample. From the analysis of population genetic structure using F statistics (FIS, FIT and FST) of Wright the average values detected for FIS and FIT of 0.1347 and 0.1912, are considered moderate and moderately high, respectively. The average value of FST was 0.0652, indicating a moderate genetic differentiation between population samples examined, where the loci that contributed most to this difference were the MDH and PGM-2. The estimated gene flow expressed as number of migrants per generation (Nm) between population samples was 3.58. The dendrogram based on UPGMA method illustrates the smallest genetic distance between population samples of Trombetas and Uatumã, where such samples are presumably part of a large panmitic population i.e. the same stock, and the largest genetic distance of these samples in relation to the Tapajós sample. Exact test for population differentiation of pairwise comparisons between the population samples, revealed highly significant statistical differences among all comparisons made with the sample of Tapajós. The data presented herein point to a possible existence of distinct subpopulations stocks of P. expansa in the area sampled. It is especially recommended that the region of the Tapajós must be a further researched and programs for the preservation and management of the P. expansa more intensified in the whole Amazon region in order to maintain the genetic variability of its populations. Futhermore the data were tentatively interpreted in the light of the refuge hypothesis.
metadata.dc.description.resumo: O presente estudo teve por objetivo avaliar o potencial das proteínas plasmáticas na identificação dos estoques da tartaruga da Amazônia (Podocnemis expansa Schweigger, 1812). Por meio da técnica de eletroforese em gel de amido três sistemas protéicos: transferrina (Tf), albumina (Alb) e proteínas gerais (PG), e quatro enzimáticos: esterase (EST EC 3.1.1.1), fosfoglucomutase (PGM EC 2.7.5.1), malato desidrogenase (MDH EC 1.1.1.37) e superóxido dismutase (SOD EC 3.15.1.1), extraídos do plasma sanguíneo de três amostras populacionais: Uatumã-AM, Trombetas-PA e Tapajós-PA, foram analisadas. As zonas de atividade eletroforética nos géis foram codificadas presumivelmente por 11 locos, dos quais, sete mostraram-se monomórficos (PG-1, PG-2, EST-1, EST-2, PGM-1, SOD-1 e SOD-2) e quatro polimórficos (Tf, Alb, MDH e PGM-2). Na comparação da distribuição alélica e genotípica, dos quatro locos polimórficos, assumindo-se o equilíbrio de Hardy-Weinberg, o MDH foi o único que não exibiu um bom balanço genético-populacional. Análises do qui-quadrado (x2) para testar a hipótese de segregação independente entre os pares de locos polimórficos examinados, não revelaram diferenças estatisticamente significativas. Tabelas de contingência para cálculo do qui-quadrado (x2) aplicados para examinar a1 distribuição dos alelos do loco Tf, não revelaram variação temporal estatisticamente significativa (x2 5= 3.05, 0.70 > P > 0.50) nas áreas amostradas. Mesmo com todas as pressões existentes, sobretudo devido ao alto consumo humano da tartaruga da Amazônia na região, os programas de conservação das populações naturais vêm garantindo a manutenção da variabilidade genética das mesmas ao longo do tempo, pelo menos para o loco Tf. As estimativas de variação genética revelaram os maiores valores de polimorfismo (36,36%), número médio de alelos por loco (1,36) e heterozigosidade média esperada (He) (0,1211), na amostra populacional do Tapajós. Nas estimativas da estrutura genético-populacional, utilizando a estatística F (FIS, FIT e FST) de Wright, os valores médios detectados para FIS e FIT de 0,1347 e 0,1912, são considerados moderado e moderadamente alto, respectivamente. O valor médio de FST foi de 0,0652, indicando uma diferenciação genética moderada entre as amostras populacionais examinadas, onde, os locos que mais contribuíram para essa diferenciação foram o MDH e PGM-2. A estimativa de fluxo gênico expressa como número de migrantes por geração (Nm) entre as amostras populacionais foi de 3,58. O dendrograma baseado no método UPGMA ilustra o menor distanciamento genético entre as amostras populacionais do Uatumã e Trombetas, onde, tais amostras presumivelmente, fazem parte de uma grande população panmítica, i.e. um mesmo estoque, bem como o maior distanciamento genético destas amostras em relação à amostra do Tapajós. Testes exatos de diferenciação populacional das comparações par-a-par entre as amostras populacionais, revelaram diferenças estatísticas altamente significativas, entre todas as comparações feitas com a amostra populacional do Tapajós. Os dados ora apresentados, apontam para uma possível existência de subpopulações estoques distintas de P. expansa na área amostrada. Recomenda-se, em especial, que a região do Tapajós seja mais pesquisada, e os programas de preservação e manejo da tartaruga da Amazônia mais intensificados em toda região amazônica a fim de manter a variabilidade genética de suas populações. Os dados foram ainda tentativamente interpretados a luz da hipótese de Refúgios.
Appears in Collections:Mestrado - GCBEv

Files in This Item:
File SizeFormat 
tese_inpa.pdf1,17 MBAdobe PDFView/Open


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons