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Estrutura e diversidade genética de uma ave de sub-bosque em uma paisagem em transformação pela urbanização na Amazônia Central

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A expansão urbana representa uma das principais ameaças à biodiversidade em regiões tropicais, afetando especialmente espécies florestais com baixa capacidade de dispersão. Neste estudo, investigamos os efeitos da paisagem fragmentada sobre a diversidade genética, estrutura populacional e fluxo gênico de Glyphorynchus spirurus, uma ave insetívora e especialista de sub-bosque, em um mosaico de áreas urbanas, fragmentos florestais e florestas contínuas na região de Manaus, Amazonas. Foram amostrados indivíduos em seis localidades com diferentes graus de conectividade e integridade florestal. Análises genéticas revelaram níveis moderados de diversidade, mas com forte sinal de estruturação genética, especialmente no grupo da UFAM, um fragmento isolado em matriz urbana, que apresentou os menores índices de diversidade genética e os mais altos níveis de parentesco local. A diferenciação genética entre populações foi estatisticamente significativa, refletindo efeitos da resistência da matriz urbana ao fluxo gênico. Modelos de conectividade indicaram que a conectividade genética é melhor explicada pela resistência imposta por elementos da paisagem do que pela distância geográfica entre populações, caracterizando um padrão de isolamento por resistência. Detectamos eventos de dispersão entre áreas de floresta contínua ou parcialmente conectadas, enquanto fragmentos urbanos, como a UFAM, mostraram isolamento funcional. Esses resultados evidenciam o impacto da fragmentação de habitat em uma paisagem urbana sobre a dinâmica genética de aves florestais especializadas e reforçam a importância de manter e restaurar a conectividade funcional em paisagens urbanizadas para a conservação da biodiversidade amazônica. Palavras-chave: conectividade genética, isolamento por resistência, fragmentação urbana, aves florestais, fluxo gênico, diversidade genética, Glyphorynchus spirurus.

Abstract:

Urban expansion represents one of the main threats to biodiversity in tropical regions, especially affecting forest-dwelling species with low dispersal capacity. In this study, we investigated the effects of a fragmented landscape on the genetic diversity, population structure, and gene flow of Glyphorynchus spirurus, an insectivorous understory specialist bird, in a mosaic of urban areas, forest fragments, and continuous forests in the region of Manaus, Amazonas. Individuals were sampled from six localities with varying degrees of forest connectivity and integrity. Genetic analyses revealed moderate levels of diversity but a strong signal of genetic structure, particularly in the UFAM group, an isolated fragment within an urban matrix, which showed the lowest levels of genetic diversity and the highest levels of local relatedness. Genetic differentiation between populations was statistically significant, reflecting the effects of the urban matrix in limiting gene flow. Connectivity models indicated that genetic connectivity is better explained by landscape resistance than by geographic distance, characterizing a pattern of isolation by resistance. We detected dispersal events between continuous or partially connected forest areas, while urban fragments such as UFAM showed functional isolation. These results highlight the impact of urban fragmentation on the genetic dynamics of specialized forest birds and reinforce the importance of maintaining and restoring functional connectivity in urbanized landscapes for the conservation of Amazonian biodiversity. Keywords: genetic connectivity, isolation by resistance, urban fragmentation, forest birds, gene flow, genetic diversity, Glyphorynchus spirurus.

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