Dissertação
Caracterização citogenômica e Dna Barcoding de três espécies de Oecomys (Rodentia: Sigmodontinae) da Amazônia brasileira
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Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia - INPA
Resumo
Dentre os roedores sul-americanos, a família Cricetiadae contêm o maior número
de representantes, distribuídos em uma única subfamília, Sigmodontinae.
Oryzomyini é uma das sete tribos reconhecidas de Sigmodontinae, que por sua
vez é composta por 27 gêneros, entre os quais o Oecomys, composto
atualmente por 16 espécies. Esse táxon apresenta uma difícil classificação
sistemática devido a pouca diferenciação morfológica e grande variabilidade
cariotípica. Assim sendo, o presente trabalho teve como objetivo contribuir para a
caracterização cromossômica e análise das relações filogenéticas entre as
espécies do gênero Oecomys da Amazônia brasileira. Para isso, 30 indivíduos de
quatro localidades distintas foram analisados. Três espécies foram reconhecidas:
Oecomys auyantepui apresentou dois citótipos distinto, 2n=64, NFa=110 e 2n=66
NFa=114, apesar disto, as técnicas citogenéticas empregadas foram similares
entre os citótipos. O bandeamento C evidenciou marcações centroméricas
tênues em todos os cromossomos, a sonda de rDNA 5S evidenciou duas
marcações; três marcações foram observadas pela coloração com nitrato de
prata e 4 para a sonda de rDNA 18S. A FISH telomérica evidenciou uma
marcação intersticial em ambos citótipos no cromossomo sexual X, indicando um
possível rearranjo cromossômico. A análise molecular corrobora a similaridade
citogenética, apenas um clado foi formado com distância intraespecífica de
1,41%, e com alto valor de suporte nodal. Para Oecomys bicolor não houve
variação entre as técnicas citogenéticas empregadas, encontrando 2n=80 e
NFa=142, a heterocromatina constitutiva se distribuiu pelos centrômeros, e se
espalhou pelos braços curtos de alguns cromossomos, com marcações
conspícuas. O nitrato de prata evidenciou 7 marcações, que representam as
regiões organizadoras de nucléolo ativas, e a sonda de rDNA 18S 24 marcações,
sugerindo uma possível duplicação e dispersão dessas sequências. A sonda de
rDNA 5S apresentou 2 marcações. Pela análise molecular 3 grupos foram
formados, com distância genética entre eles que varia de 7,12% a 13,44%,
sugerindo representar um complexo de espécies. Oecomys rutilus apresentou
2n=54 e NFa=90, a distribuição da heterocromatina foi do tipo tênue com
distribuição pelos centrômeros, porção pericentromérica e terminal. Quatro
marcações foram observadas pela coloração com nitrato de prata, assim como
pela sonda de rDNA 18S. O sítio ribossomal 5S apresentou apenas 2 marcações.
Dois clados foram formados pela análise molecular, com alto suporte nodal,
condizentes com distribuição geográfica entre os espécimes. A análise molecular
sugere que Oecomys rex seja o táxon basal para o grupo.
Abstract:
Among South American rodents, the Cricetiadae family contain the largest number of
representatives allotted in a single subfamily, Sigmodontinae. Oryzomyini is one of
the seven tribes recognized as Sigmodontinae, which is composed by 27 genera,
including Oecomys genus with 16 species. This taxon presents a difficult systematic
classification due to limited morphological variability and great karyotype
differentiation. Therefore, this study aims to contribute to the chromosomal
characterization and analysis of phylogenetic relationships among species of the
Oecomys genus from Brazilian Amazon. In this study, 30 individuals were analyzed
in four different regions. Four species were recognized as Oecomys auyantepui with
two distinct cytotypes, 2n=64, FN=110 and 2n=66, FN=114, despite this, cytogenetic
techniques employed were similar between the cytotypes. C banding revealed
centromeric faint markings in all chromosomes, the 5S rDNA probe showed two
marks, three marks were observed by silver-staining, and 4 for the 18S rDNA probe.
The telomeric FISH showed an interstitial marking on both cytotypes of the sex
chromosome X, indicating a possible chromosomal rearrangement. Molecular
cytogenetic analysis supports the similarity, only one clade was formed with
intraspecific distance of 1,41%, and high value of nodal support; For Oecomys bicolor
no variation among cytogenetic techniques employed, with 2n=80 and FN=142 ,
constitutive heterochromatin was distributed by centromeres and spread by short
arms of some chromosomes with conspicuous markings. Silver-staining showed 7
tags, which represent the active nucleolus organizer regions, and 24 markings with
18S rDNA probe, suggesting a possible duplication and dispersion of these
sequences. The 5S rDNA probe showed 2 tags. Molecular analysis of 3 groups were
performed with genetic distance between them ranging from 7, 12% to 13,44%,
suggesting a species complex; Oecomys rutilus had 2n=54 and FN=90, distribution
of heterochromatin was the faint type distribution with the centromeres ,
pericentromeric portion and terminal. Four markers were observed by silver-staining,
as well as the 18S rDNA probe. The site ribosomal 5S showed only two markings.
Two clades were formed by molecular analysis with high nodal support consistent
with a geographical distribution among the specimens. Oecomys rex was considered
basally among all Oecomys species in molecular analysis.
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