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https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/39899
Title: | Análise do Transcriptoma de Fígado do Tambaqui (Colossoma macropomum) Exposto ao Organofosforado Triclorfon |
Other Titles: | Analysis of the Liver Transcriptome of Tambaqui (Colossoma macropomum) Exposed to the Organophosphate Triclorfon |
Authors: | Silva, Hallana Cristina Menezes da |
metadata.dc.contributor.advisor: | Matoso, Daniele Aparecida |
metadata.dc.contributor.co-advisor: | Artoni, Roberto Ferreira |
Keywords: | Tambaqui Triclorfon |
Issue Date: | 24-Feb-2023 |
metadata.dc.publisher.program: | Genética, Conservação e Biologia Evolutiva - GCBEv |
Abstract: | Organophosphate compounds are commonly used in fish farming systems to control fish parasites that can affect production and cause economic damage. However, studies over the years have shown that these compounds can not only combat the proliferation of parasites, but also cause harm to the animals being treated. Trichlorfon is one of the organophosphate compounds used in fish farming for this purpose, with its dosage varying according to the organism it seeks to eliminate. Reports of damage to oxidative stress pathways, imbalance in biochemical pathways responsible for cellular respiration, damage to DNA, impairment of ionic transport pathways, activation of pathways linked to tumorigenesis and apoptosis and autophagy pathways are common in exposed fish. Furthermore, damage to tissues, especially the liver and gills, is common. This work sought to define the LC50-96h of trichlorfon for the species Colossoma macropomum (tambaqui) and evaluate, through RNA-Seq, the genes related to the response in the liver of tambaqui specimens exposed to 50% of the LC50-96h (0.435 mg/ L) of trichlorfon for 96 hours. The LC50-96h for the species was defined at a value of 0.870 mg/L, points of necrosis were also found in some tissues of the exposed fish and they lost their swimming balance when exposed to the last concentration (3.2 mg/L). RNA-Seq analysis showed about 176 genes differentially expressed in the samples exposed to trichlorfon, compared to the control group where these genes participate in several exposure response pathways. GO analysis showed the enriched functions, where most of the mapped genes are solute carriers and participate in functions such as transmembrane transport activity, transport activity and ion transport. The analysis of enriched pathways through KEGG showed around 63 pathways enriched by exposure, including the xenobiotic metabolism pathway through cytochrome p450, the drug metabolism pathway through cytochrome p450 and the drug metabolism pathway involving other enzymes. The data found in this work corroborate results described in the literature for other fish species, as well as providing support for further studies on the exposure of fish to organophosphate compounds, mainly trichlorfon. |
metadata.dc.description.resumo: | Os compostos organofosforados são comumente utilizados em sistemas de piscicultura para o controle de parasitos de peixes que podem acometer a produção e causar danos econômicos. Porém, estudos ao longo dos anos vêm mostrando que esses compostos não só podem combater a proliferação de parasitos, como também causar danos aos animais que estão sendo tratados. O triclorfon é um dos compostos organofosforados utilizado na piscicultura para este fim, tendo sua dosagem variando de acordo com o organismo que se busca eliminar. São comuns relatos de danos às vias de stress oxidativo, desbalanço nas vias bioquímicas responsáveis pela respiração celular, danos ao DNA, comprometimento de vias de transporte iônico, ativação de vias ligadas a tumorogênese e vias de apoptose e autofagia nos peixes expostos. Ainda, são comuns danos aos tecidos, principalmente fígado e brânquias. Este trabalho buscou definir a CL50-96h do triclorfon para a espécie Colossoma macropomum (tambaqui) e avaliar, através de RNA-Seq, os genes relacionados a resposta em fígado de espécimes de tambaqui expostos à 50% da CL50-96h (0,435 mg/L) de triclorfon durante 96 horas. A CL50-96h para a espécie foi definida no valor de 0,870 mg/L, foram encontrados também pontos de necrose em alguns tecidos dos peixes expostos e eles perderam o equilíbrio natatório quando expostos à última concentração (3,2 mg/L). A análise de RNA-Seq mostrou cerca de 176 genes diferencialmente expressos nas amostras expostas ao triclorfon, em comparação com o grupo controle onde esses genes participam de várias vias de resposta à exposição. A análise GO mostrou as funções enriquecidas, onde a maioria dos genes mapeados são carreadores de soluto e participam de funções como atividade de transporte transmembrana, atividade transportadora e transporte de íons. A análise de vias enriquecidas através do KEGG mostrou cerca de 63 vias enriquecidas pela exposição, onde pode-se destacar a via de metabolismo de xenobióticos pelo citocromo p450, via de metabolismo de drogas pelo citocromo p450 e via de metabolismo de drogas envolvendo outras enzimas. Os dados encontrados neste trabalho corroboram resultados descritos na literatura para outras espécies de peixes, bem como fornecem subsídios para estudos posteriores sobre a exposição de peixes à compostos organofosforados, principalmente o triclorfon. |
Appears in Collections: | Doutorado - GCBEv |
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